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决定急性期C 反应蛋白表达模式的远端增强子的鉴定

日期: 2022-06-28 阅读:

作者:王铭裕,张春苗,周海红,葛仲伯,苏晨琛,娄子豪,张昕云,许桃桃,李思毅,朱莉,周雅丽,武一,吉尚戎

期刊:The Journal of biological chemistry

单位信息:

兰州大学生命科学学院:王铭裕,张春苗,葛仲伯,苏晨琛,娄子豪,张昕云,许桃桃,李思毅,朱莉,吉尚戎

甘肃省肿瘤医院:周海红

兰州大学第二医院:周雅丽

西安交通大学基础医学院:武一

摘要:C 反应蛋白 (CRP) 是一种主要的急性期蛋白和炎症标志物,其主要在肝脏中特异性诱导表达。增强子是调节基因表达的关键调控元件,但增强子对 CRP 表达模式的贡献尚未明确。本工作我们确定了位于CRP 启动子上游 37.7 kb 的组成型增强子 (E1)。通过使用染色质免疫沉淀、荧光素酶报告基因检测、原位基因删除、CRISPRi 和 CRISPRa等技术,我们发现 E1含有STAT3 和 C/EBP-beta转录因子结合位点,对于诱导表达CRP 至关重要。此外,我们通过检测不同物种间E1 启动子的活性和相关的表观遗传修饰,发现 E1 与 CRP 的启动子以协同的方式,共同决定了组织间和不同物种中CRP表达模式的差异。因此,这些结果表明了一种有趣的分子进化模式,其中远端调节元件中的位点变异,导致表达水平的改变,进而引发了随后的蛋白功能上的选择,这一功能选择过程包括远端/近端调节元件的突变和改变蛋白活性的编码区突变之间的协同进化。

原文链接:https://www.jbc.org/article/S0021-9258(22)00602-0/fulltext